Sammlung Wyser - Stiche 
Die Sammlung Wyser ist eine Sammlung von rund 350 alten Grafiken aus der Region Schaffhausen, welche im Herbst 1991 im Ostflügel des Klostergutes Paradies eingerichtet wurde. Die Sammlung ist in sechs Räumen untergebracht, wobei jeder Raum eine spezielle Thematik behandelt. Zusätzlich werden in Vitrinen Exponate der Sammlung wie Dokumente oder Bücher ausgestellt. Ebenfalls in Vitrinen dargestellt werden Aspekte der Grafik als Handwerk wie z. B. Platten zu Stahl- und Kupferstichen.

Sammlung Rohr - Landkarten
Die Sammlung Rohr umfasst heute rund 80 Blätter alter Landkarten aus dem Kanton Schaffhausen, 47 davon sind ausgestellt. Im Nordflügel des Klostergutes Paradies kann die Sammlung, die sich über einen Zeitraum von 1525 bis 1897 erstreckt, in einer überschaubaren Ausstellung betrachtet werden. Nach heutigem Wissensstand ist die Sammlung alter Schaffhauser Kantonskarten praktisch vollständig. Neben Kantonskarten sind aber auch Pläne der Stadt Schaffhausen zu sehen. Eine der ersten gedruckten Karten der Schweiz rundet die Ausstellung ab.

Sammlung Mettler - Kunstsammlung
In optimaler Ergänzung zu den Sammlungen Wyser und Rohr steht die "Rheinfallsammlung Peter Mettler". Dabei handelt es sich um rund 300 Ansichten des Rheinfalls, die vor dem Jahr 1850 (Bau der Eisenbahnbrücke) entstanden sind und von dem privaten Sammler Peter Mettler zusammengetragen wurden. Die Kollektion umfasst Ölgemälde, Zeichnungen, Aquarelle, Gouachen, Holzschnitte, Radierungen, Kupferstiche, Aquatintas, Lithographien etc..